Les ateliers sont l’épine dorsale de la méthodologie collaborative et des pratiques de recherche de Mémoire survivante dans l’après-guerre au Salvador. C'est par le biais d'ateliers qui se passent le développement, la conduction et  l’évaluations des recherches. Les ateliers sont utilisés pour des initiatives de formation et de renforcement des capacités avec les membres de l'équipe, les étudiant·es et les membres de la communauté. Depuis 2017, Mémoire Survivante a organisé des centaines d’ateliers de courte et longue durée, allant de petits groupes de discussion à de grands événements de plusieurs jours.